Beiträge von Bernd Miggel

  • DNA-Sequenzierungen



    Hallo Craterelle,


    danke für deine Hinweise, allmählich geht's voran.
    Man sollte sich Chromatogramm plus Basensequenzen bestellen, etwa 20,- Eur. für eine ITS-Sequenz.
    Ein paar Sequenzen von eigenen Russula-Funden besitze ich jetzt, habe in den vergangenen Tagen damit BLAST-Übungen durchgeführt und mit den Vergleichsergebnissen dann via MEGA 7 phylogenetische Bäume erstellt.
    Für mich als Hobby-Mykologen ist das schon sehr gewöhnungsbedürftig!


    Heute habe ich deine Vorschläge aufgegriffen und aus der Unite-Datenbank Sequenzen herauskopiert. Mit diesen dann MAFFT gefüttert und NJ-Trees erstellt. Hat eigentlich ganz gut funktioniert.


    Kannst du mir verraten, ob es eine elegante Methode gibt, die Unite-Sequenzen nach MAFFT zu übertragen? Meine Methode mit Copy und Paste der einzelnen Sequenzstränge ist ziemlich aufwändig!


    Herzliche Grüße
    Bernd

  • DNA-Sequenzierungen

    Hallo,


    heute habe ich für einen Täubling bei Pablo Alvarado in Spanien (alvalab.es) die DNA-Sequenzierung inkl. des Phylogenetischen Baumes bestellt. Bin sehr gespannt, was dabei rauskommt!


    Zukünftig möchte ich nur noch die Basensequenz erstellen lassen und den Rest am PC selber machen.
    Wer kann mir dabei weiterhelfen? Welche freien Programme und Genbanken gibt es bzw. kann man empfehlen?


    Jeder Tipp ist willkommen!


    L.G. - Bernd

  • Russula chloroides???

    Hallo,


    was den grünlichen Reflex angeht, lasse ich lieber Andreas antworten, für mich ist das ein heikles Thema. ;)
    Aber - Pappeln gehen durchaus eine Mykorrhiza mit einigen Täüblingen und Milchlingen ein!


    L.G. - Bernd

  • PP-0018 - Caryospora putaminum auf der Schale eines Pfirsichkerns

    Hallo,


    gestern konnte ich mit Björn über seinen mit Caryospora callicarpa bezeichneten Beleg sprechen. Diese Beschriftung war ein reines Versehen seinerseits. In seinem Buch hat er unter der Nr. 670 Caryospora putaminum als die auf Pfirsichkernen wachende Art ausführlich beschrieben. Das hätte mir natürlich auffallen müssen! :shy:
    Den Artnamen für dieses Pyrenomyceten-Portrait werde ich natürlich richtigstellen.


    Viele Grüße


    Bernd

  • Caryospora putaminum versus C. callicarpa?


    Hallo Pablo,


    wahrscheinlich sehe ich Björn morgen in Hornberg bei der Jahrestagung der Stuttgarter Pilzfreunde.


    Herzlichen Gruß


    Bernd

  • Caryospora putaminum versus C. callicarpa?



    Hallo Pablo,


    in Jeffers WF (1940): Studies on Caryospora putaminum werden folgende Unterschiede angegeben:


    Caryospora putaminum: Wächst auf den Schalen von Pfirsichkernen und ähnlichem Substrat; Sporenzahl im Ascus = 1-7, wobei die meisten Asci 3- oder 4-sporig sind. 8-sporige Asci wurden nicht beobachtet.


    Caryospora callicarpa: Wächst auf dem Holz abgestorbener Eichen und auf der Rinde von Schwarzpappeln; Sporenzahl im Ascus = 8


    Diesen Angaben zufolge müsste es sich bei dem von mir beschriebenen Fund um Caryospora putaminum handeln. - Oder?


    Herzliche Grüße


    Bernd

  • Was bin ich?


    Hallo Brassella,
    ich gebe mich geschlagen, wenn es auch schwer fällt. ;)
    L.G. - Bernd

  • Was bin ich?



    Hallo Brassella,


    Rätselfrage-Pilz und Rätselantwort-Pilz sehen für mich am Stiel ziemlich unterschiedlich aus. Ist das wirklich dieselbe Art? :/


    L.G. - Bernd


  • Was bin ich?

    Hallo an alle!


    wegen des ungenetzten Stiels, der so dick ist wie der Hut breit (und der zudem noch die Farbe des Pavianhinterns hat), entscheide ich mich für den seltenen Satanspilz!


    L.G. - Bernd

  • Was bin ich?



    Hallo Brassella,


    hat der gefundene Pilz eigentlich einen genetzten Stiel, wie es für Rubroboletus legaliae verlangt wird?


    L.G. - Bernd

  • Unidentifizierter Gelber Röhrling

    Zitat von Oehrling


    Hallo Bernd,
    ich finde, Boletus mendax ist ziemlich genau beschrieben. Er hat griffige Differenzierungsmerkmale, die ich glaube im Feld erkennen zu können.
    FG
    Oehrling


    Hallo Oehrling,


    Super! Was sind das für Unterscheidungsmerkmale?
    Wir hatten nämlich letzten Samstag eine Kollektion von einem einzigen Myzel, konnten uns bei der Bestimmung aber nicht für eine der beiden Arten entscheiden.


    L.G. - Bernd

  • PP-0018 - Caryospora putaminum auf der Schale eines Pfirsichkerns

    Hallo Jan-Arne und Pablo,


    die Art scheint nicht selten zu sein, vielleicht bisher in Deutschland übersehen. Überseeisch anscheinend auf Rinde und aquatisch.
    Björn hatte mir die Art für Schleimuntersuchungen bei Pyrenomyceten-Sporen zur Verfügung gestellt.


    Interessant: Hier sieht man den Schleim bereits ohne Anfärbung (Abb. 7-9).


    Bei Phaeosphaeria herpotrichoides benötigt man dazu China/India Ink:
    https://www.pilzforum.eu/board…alm-pp-0017?highlight=pp-


    Herzliche Grüße


    Bernd

  • PP-0018 - Caryospora putaminum auf der Schale eines Pfirsichkerns

    Hier geht es zurück zur Übersicht



    Liebe Pilzfreunde,


    hier mein Pyrenomyceten-Portrait Nr. 18: Caryospora putaminum
    (mit freundlicher Genehmigung von Björn Wergen)


    Aktuell gültiger Name (Index Fungorum): Caryospora putaminum (Curr.) (Schwein.) De Not.


    Synonyme:
    Lophiostoma putaminum (Schwein.) Quél.
    Sphaeria putaminum Schwein.



    Systematik: Dothideomycetes > Pleosporales > Zopfiaceae > Caryospora


    leg. & det.: Wergen, B.
    Fund: 20.05.2015 Arcene, Italien


    Substrat: Die Perithecien sitzen einzeln, in lockerer Verteilung, auf der Innenseite eines verrottenden Pfirsichkerns (Abb. 1-2).


    Perithecien kohlig schwarz, hart, glatt, kugelförmig, nach oben kegelförmig verjüngt, etwa 0,6-0,8 mm im Durchmesser, nur mit der Basis ins Substrat eingesenkt, Ostiolen papillat, große Öffnung (Abb. 3).


    Asci bitunikat, breitkeulig bis sackförmig, kurz gestielt, beim Fund 3-5-sporig, Sporen im Ascus unregelmäßig 2-lagig, 150-200 x 51-70 µm, Ascusporus IKI-negativ (Abb. 4-7).


    Sporen spindelförmig, glatt, beim Fund meist mit einer einzigen, zentralen Quersepte, an dieser eingeschnürt, jung hyalin, ausgereift braun, mit deutlicher Schleimhülle (Abb. 7-10).
    Sporen sehr groß, gemessen: 111x30, 117x34, 91x32, 95x35, 75x24, 100x29, 118x34, 117x28, 101x25
    => 75-118 x 24-35; Q = 2.7-4.2


    Literatur:
    Asco France: Sur Noyau de Peche: http://www.ascofrance.com/forum/14430/sur-noyau-de-peche
    BERLESE AN (1894 ) Icones Fungorum Vol. I. Pyrenomycetes: Tab. XVI
    BARR ME (1979): Massariaceae in Northamerica: 21-24
    ELLIS & EVERHARDT (1905): North American Pyrenomycetes: 209-210
    Jeffers WF (1940): Studies on Caryospora putaminum
    MIGULA W (1913): Kryptogamenflora. Bd. III Pilze. 3. Teil. 1. Abt. Ascomycetes: Hemiasci,
    Saccharomycetineae, Protodiscineae, Plectascineae, Pyrenomycetes (Perisporiales und Sphaeriales): 229-230
    Nederlandse Ascomyceten Project: https://www.allesoverpaddenstoelen.nl/Aop2_Ascoproject.html
    WERGEN B (2017): Handbook of Ascomyceta. Vol. Ib. Pyrenomycetes s.l. mit zweifach septierten bis mauerförmigen Sporen: Nr. 670
    Winter G (1887): Rabenhorst Kryptoganenflora - Ascomyceten. Gymnoasceen und Pyrenomyceten: 278-279



    Unterschiede zu der sehr ähnlichen Art Caryospora callicarpa (Jeffers WF (1940): Studies on Caryospora putaminum:(


    Caryospora putaminum: Wächst auf den Schalen von Pfirsichkernen und ähnlichem Subsrat; Sporenzahl im Ascus = 1-7, wobei die meisten Asci 3- oder 4-sporig sind. 8-sporige Asci wurden nicht beobachtet.


    Caryospora callicarpa: Wächst auf dem Holz abgestorbener Eichen und auf der Rinde von Schwarzpappeln; Sporenzahl im Ascus = 8



    Herzliche Grüße


    Bernd


    P.s.: Meine Pyrenomyceten-Portraits findet man über den Suchbegriff "PP-0" oder "PP-".



  • PP-0017 - Phaeosphaeria herpotrichoides auf Grashalm



    Hallo Irmtraud,


    nach Ellis & Ellis (1997) auf Luzula sylvatica, Phalaris arundinacea, Phragmites australis, Phragmites communis, LUZULA, CAREX und DESCHAMPSIA. Hoffentlich sagt dir das etwas! ;)


    Einen herzlichen Gruß


    Bernd

  • PP-0017 - Phaeosphaeria herpotrichoides auf Grashalm

    Hier geht es zurück zur Übersicht



    Liebe Pilzfreunde,


    hier wage ich mein Pyrenomyceten-Portrait Nr. 17: Phaeosphaeria herpotrichoides
    (mit freundlicher Genehmigung von Björn Wergen)


    Aktuell gültiger Name (Index Fungorum): Phaeosphaeria herpotrichoides (De Not.) L. Holm


    Synonyme:
    Heptameria herpotrichioides (De Not.) Cooke
    Leptosphaeria herpotrichoides De Not.


    Systematik: Dothideomycetes > Pleosporales > Phaeosphaeriaceae > Phaeosphaeria


    leg. & det.: Wergen, B.
    Fund: 18.07.2015, Baden-Württemberg, Rensberg, MTB 7815/131


    Substrat: Die Perithecien sitzen einzeln, in lockerer Verteilung, auf einem trockenen Grashalm, dessen Rinde sie mit ihrer Mündung durchbrechen (Abb. 1-3).


    Perithecien schwarz, birnenförmig, etwa 0,2 mm im Durchmesser, Ostiolen papillat (Abb. 4).


    Asci bitunikat, keulig, rel. kurz gestielt, 8-sporig, Sporen im Ascus 2-3-lagig, Ascusporus IKI-negativ (Abb. 5-6).


    Sporen spindelförmig, schwach gekrümmt, glatt, beim Fund meist mit 6 Quersepten, an diesen leicht eingeschnürt, bräunlich oder grünlich (Abb. 7, 8), mit deutlicher Schleimhülle (Abb. 9)
    Das Segment über dem Primärseptum (3. Segment vom Apex aus) ist oft tonnenförmig angeschwollen.
    Sporenmaße beim Fund 23-30 x 3-3,8 µm, Q 6,7-8,2.


    Literatur:
    DENNIS R W G (1981): British Ascomycetes:444, Fig. 24T
    ELLIS MB & ELLIS JP (1997): Microfungi on land plants: Plate 171
    Eriksson O (1967): On graminicolous Pyrenomycetes from Fennoscandia 2. Phragmosporus and
    Scolecosporus species –“ Arkiv f. Bot. 6: 381–“ 440
    GHORBAN ALI & HEDJAROUDE A (1968/1969): Etudes taxonomiques sur les Phaeosphaeria Miyake et leurs
    formes voisines (Ascomycètes) –“ Sydowia 22: 57-107
    LAMMERS H: NMV-Ascomycetenproject - Sleutels tot soorten uit de geslachten Leptosphaeria,
    Paraleptosphaeria, Paraphaeosphaeria, Phaeosphaeria, Phaeosphaeriopsis, Plenodomus
    LEUCHTMANN A (1984): Über Phaeosphaeria MIYAKE und andere bitunicate Ascomyceten mit mehrfach
    querseptierten Ascosporen –“ Sydowia 37: 75-194
    SCHMID-HECKEL H (1988): Nationalpark Berchtesgaden. Forschungsbericht 15
    SHOEMAKER R A & BABCOCK C E (1989): Phaeosphaeria –“ Canadian Journal of Botany 67: 1500-1599.
    WERGEN B (2017): Handbook of Ascomycota. Vol. Ia, Ib


    Anmerkung: LEUCHTMANN A (1984) führt Phaeosphaeria herpotrichoides als Artengruppe mit drei Formen.



    Herzliche Grüße


    Bernd



    P.s.: Meine anderen Pyrenomyceten-Portraits sind über den Suchbegriff "PP-0" zu finden.



  • DNA-Sequenzierungen



    Hallo Florian,


    es geht um Russula und evtl. Lactarius/Lactifluus. Beginnen möchte ich mit Russula pallidospora.


    Liebe Grüße


    Bernd